Tiede: Paljastaa autismiin liittyvät hermosolutyypit

Uudessa tutkimuksessa tutkijat tutkimuslaitoksista, kuten Kalifornian yliopistosta, San Franciscosta (Yhdysvallat, San Francisco, Kalifornia, USA), ovat kuolleet yli 100 000: lla autismispektrin häiriöiden (ASD) ihmisten kuolemantapauksessa ja ihmiset ilman ASD: tä. Taka-aivosolujen ydinautosekvensointi paljasti geenityypit, joita säädellään poikkeavasti tässä taudissa, ja solutyypit, joille tällainen poikkeava säätely tapahtuu. Nämä tulokset auttavat rajaamaan tulevaisuuden ASD-tutkimuksen painopistettä todennäköisimpiin molekyylin ja solun poikkeavuuksiin. Asiaankuuluvat tutkimustulokset julkaistiin Science-lehdessä toukokuussa 17, 2019, ja tutkimuksen otsikko oli 0010010 quot; Yhden solun genomiikka tunnistaa solutyyppikohtaiset molekyylimuutokset autismi 0010010 quot ;.

Kuva tieteestä, 2019, doi: 10. 1126 / science.aav 8130.

0010010 quot; Se käyttää uusinta tekniikkaa, se tekee tutkimusta yksisolutasolla, se validoi ja laajentaa aiempia havaintoja, 0010010 quot; sanoi Daniel Geschwind, autismin tutkija Los Angelesin Kalifornian yliopistossa (ei mukana uudessa tutkimuksessa). Aikaisempi tutkimus on tuonut meidät ratkaisutasolle, jota emme ole koskaan aikaisemmin saavuttaneet. 0010010 quot;

San Franciscon Kalifornian yliopiston geneetikko Stephan Sanders (ei mukana uudessa tutkimuksessa) lisäsi, 0010010 quot; Tämä on kokeilu, joka on tehtävä. Organisaatiotasolla se toistaa laajasti aiempia tutkimuksia autismista. . Sitten ensimmäistä kertaa se tarkasteli, mitkä solutyypit tekivät nämä erot. 0010010 quot;

Tällä hetkellä ASD: n esiintyvyys lapsilla Yhdysvalloissa on noin 1 60. Tämä tauti kattaa monenlaiset sairaudet, joille on ominaista heikentynyt kommunikointi ja sosiaaliset taidot. ASD: n heterogeenisyys vaikeuttaa sen molekyylipatologian tutkimusta. Ensimmäinen kirjailija Dmitri Velmeshev, tutkijatohtori Kalifornian yliopistossa, San Franciscon neurologissa Arnold Kriegsteinin 0010010 # 39 laboratoriossa, sanoi, että geeniekspressiotutkimuksissa ASD-potilaiden post mortem -kudoksessa on tunnistetut reitit, joihin yleensä vaikuttaa, mukaan lukien synaptinen toiminta.

Sanders huomautti, että aikaisemmat tutkimukset ovat lisäksi viitanneet taipumukseen vähentyneeseen hermosolujen ekspressioon ja lisääntyneeseen glia-solujen geeniekspressioon ASD: ssä. Hän kuitenkin selitti, 0010010 quot; On epäselvää, edustavatko nämä muutokset eroja tässä solun osassa (esimerkiksi suhteellisen vähän neuroneja) vai solussa esiintyviä geneettisiä poikkeavuuksia. 0010010 quot;

Velmeshev selitti, että tämä johtuu siitä, että 0010010 quot; se, mitä ihmiset tekevät, on paljon geeniekspressiotutkimusta, mikä tarkoittaa, ettei ole suoraa tapaa tutkia tiettyjä solutyyppejä. 0010010 quot; Nykyään käyttämällä äskettäin kehitettyä sekvensointitekniikkaa, nimeltään yhden ytimen RNA-sekvensointi, Velmeshev ja hänen kollegansa ovat kokeilleet yli 50 000 yksisoluista ydintä 15 ASD-potilaiden ja 16 aivokuoresta hallitsee geeniekspressiota yli 50 000 ytimessä kohteen 0010010 # 39 aivoissa.

Yksittäisten ytimien automaattisen erottamisen pisaroiksi, viivakoodien leimaamisen ja RNA: n sekvensoinnin jälkeen saadut tiedot osoitetaan automaattisesti yksittäisille soluille niiden viivakoodien perusteella, jolloin solutyypit voidaan määrittää niiden avainmerkkigeenien ekspression perusteella. Tällä tavoin Velmeshevin 0010010 # 39 joukkue pystyi havaitsemaan solutyypit, joilla geeniekspressio oli merkittävästi erilainen ASD-potilaiden ja kontrollikohteiden välillä.

He havaitsivat, että ASD-potilaiden näytteissä ylemmän aivokuoren hermostoilla oli taipumusta osoittaa eniten geenihäiriöitä, ja synaptiseen toimintaan ja transkriptioon osallistuvat geenit kärsivät eniten. Aivojen immuniteetissa merkityksellisillä Microglia-potilailla on myös merkittäviä geneettisiä poikkeavuuksia potilailla, joilla on ASD, ja mikroglialien aktivaatiogeenit ja kehityksen transkriptiotekijägeenit kärsivät eniten.

Stanfordin yliopiston lääketieteellisen korkeakoulun ASD-tutkija Dennis Wall (ei osallistunut tähän uuteen tutkimukseen) sanoi 0010010 quot; Tämä on jännittävä edistysaskel, ja se näyttää olevan erittäin kohtuullinen ja tärkeä tutkimus ... erittäin yksityiskohtaisella ja tyylikkäällä tavalla Lähestymistapa kuvaa vaikutustapahtumat. Se auttaa korostamaan aluetta, jolla odotetaan lisätutkimusta. 0010010 quot;

Vaikka Joseph Buxbaum Icahnin lääketieteellisestä korkeakoulusta Mount Sinai -yhtiöltä Yhdysvalloista uskoo 0010010 quotin, tämä on tyylikäs tutkimus 0010010 quot ;, hän on huolissaan otoksen koosta. Hän sanoi kyllä, siellä voi olla enemmän kuin 50 000 ydintä, mutta ne tulivat vain 15 potilaista. Hän jatkoi, että tämä ei ole 0010010 quot; näiden kirjoittajien vika 0010010 quot; mutta heijastaa 0010010 quot; iso ongelma tällä alalla - erittäin rajoitettujen aivenäytteiden 0010010 quot; perusongelma ..

0010010 quot; Uskon täysin, että kaikki tässä lehdessä on totta, mutta se ei välttämättä ole universaalia. 0010010 quot;

Velmeshev on samaa mieltä sanomalla 0010010 quot; on ehdottoman tärkeää toistaa suurempana tietojoukkona. 0010010 quot; Hän lisäsi, 0010010 quot; kun verrataan suuria määriä näytteidemme geeniekspressiotietoja aikaisemmin tuotettuihin tietoihin ... Tietojoukkojen välillä on suuri joukko yleisiä ASD: hen liittyviä transkriptionaalisia muutoksia, 0010010 quot ; Kriegstein sanoi, ja löytö 0010010 quot; on erittäin rohkaiseva. 0010010 quot; (sivustolta bioon.com, käännä hsppharma.com)

Viite:

Dmitry Velmeshev et al., 0010010 nbsp;Yksisoluinen genomiikka tunnistaa solutyyppikohtaiset molekyyliset muutokset autismissa. Tiede, 2019, doi: 10. 1126 / science.aav 8130.